A Enterprise encontra
a S.S. Botany Bay, uma nave do século XX, do período das Guerras Eugênicas
na Terra. Na Botany Bay, encontram vários corpos congelados; dentre
eles, está Khan Noonian Singh, um antigo ditador. Com a ajuda de uma
tripulante da Enterprise, a historiadora Marla McGivers, Khan e seus
homens tentam tomar o controle da Enterprise. Contudo, não são bem-sucedidos.
Kirk deixa Khan e seus homens para colonizar Ceti Alpha V, e a historiadora
Marla McGivers se junta a eles.
